Grundsätzlich scheinen Automat und Schalter mal die Preise auszugeben, die reiseauskunft.bahn.de (noch) ausspuckt. Also könnten das die hier ebenfalls schon festgestellten Unterschiede sein. Am Schalter soll die Buchungsmaschine wohl erst frühestens Mitte, Ende 2024 umgestellt werden. Möglicherweise kommen manche Preisunterschiede auch daher, dass manche Angebote über bestimmte Vertriebswege gar nicht angeboten werden.

Hat das was mit dem "alten" und dem "neuen" Buchungssystem zu tun?

lt. Artikel hat es aber auch mit unterschiedlichen Verbindungen zu tun (aus dem Artikel):

In der App sieht man die günstige Verbindung nur, wenn man "Berlin Hbf" als Abfahrtort angibt. > Wer einfach nur "Berlin" angibt, sieht diese Fahrt nicht.

und das ist ja manchmal wirklich merkwürdig. kennen hier sicher die meisten auch: Zwischenaufenthalte mit 0min Aufenthalt bringen manchmal erstaunlich günstige Verbindungen zum Vorschein, die nur wenige Minuten langsamer sind und zuvor nicht angezeigt wurden - trotz Abwahl "schnellste Verbindungen anzeigen". das könnten die sein, die am Automaten -ohne Angabe eines Zwischenaufenthalts- aufgeführt werden.

VG, bskf