Ich habe noch einmal anhand Deiner Idee mit der expliziten Abwahl von Verkehrsmitteln ebenfalls meine Wunschverbindung gefunden. Mit dieser Variante ging es nun auch:

Wenn man aber nur den Aufenthalt von 30min auf 40min hochschraubt, dann wird mir nicht mehr der ICE77 als Rückfahrt angeboten.
Dabei fährt ja eine S-Bahn von Bruchsal um 15:44 ab, mit Ankunft um 16:00. Damit wären also etwa 60min(!) Aufenthalt möglich, was eigentlich bei meiner obiger Auswahl als Trefferliste aufgeführt werden sollte!

Ich bin überzeugt, daß das ohne Hilfe kein "normaler" Bahnkunde hinbekommen hätte und hier also der Kunde mind. 12€ zuviel bezahlt hätte (da kein SP50 angeboten), wenn auch bei minimaler Zeitersparnis mit der Fahrt im ICE3 um 17:00 und Ankunft um 17:59 in Freiburg.

Oder bin ich jetzt komplett bescheuert?

Nö. Versuch es mal hiermit. Ansonsten beim Auswahlmenü für die Rückfahrt auf "weitere Angaben ändern" klicken und nochmal versuchen.

Viele Grüße,
Nicolas

Das sind die möglichen Rückfahrten, die mir die Bahn ermittelt, vollkommen unbeindruckt der zuvor festgelegten Abfahrtzeit in Bruchsal und der Aufenthaltszeit in KA:

Klickt man dann wieder aus "weitere Angaben ändern" sind die Einstellungen aus dem ersten Bild bezüglich Aufenthaltszeit in Karlsruhe weg.
Und so ähnlich hatte ich das schon öfters vor dem Fahrplanwechsel praktiziert und das hatte immer funktioniert.

Ich glaube, ihr versteht mein Problem nicht :-(
Diese Möglichkeiten der Rückfahrt werden mir einfach nicht angeboten.
Wählt doch einfach mal für eine Hinfahrt um 06:52 mit dem ICE nach Bruchsal eine Rückfahrt aus und versucht für diese gewählte Hinfahrt für Eure Vorschläge eine Rückfahrt zu erhalten.

Egal, ob ich einen Aufenthalt in Karlsruhe bei der Rückfahrt wähle oder eine feste Uhrzeit für eine Abfahrt in Bruchsal angebe, die Reiseauskunft der Bahn ergibt listet mir keine Möglichkeit auf, mit einem RE von Bruchsal nach KA zu fahren, wenn ich unbedingt den ICE77 ab KA nehmen möchte.

Oder bin ich jetzt komplett bescheuert?

Bruchsal Sa, 03.01.09 ab 16:18 4 S 3 S-Bahn Richtung: Karlsruhe Hbf
Fahrradmitnahme begrenzt möglich, Fahrzeuggebundene Einstiegshilfe: Anmeldung 01805-512512 *, (*14 ct/Min. aus dem Festnetz, Mobilfunk ggf. abweichend)
Karlsruhe Hbf Sa, 03.01.09 an 16:32 7
Karlsruhe Hbf Sa, 03.01.09 ab 17:08 2 ICE 77 Intercity-Express
Bordrestaurant
Freiburg(Breisgau) Hbf

Den ICE 509 nehme ich normalerweise, aber für den gibt an diesem Tag keinen SP50.

Und welchen Zug möchtest du denn nehmen?

Bruchsal ab 16:27 S31, KA an 16:48, ab 17:00 ICE 509, FR an 17:59.

Du kannst ja dann trotzdem schon um 15:44 Uhr mit der S-Bahn fahren, weil im NV ja keine Zugbindung besteht.
Problem gelöst?

Freiburg <--> Bruchsal (via Karlsruhe), am Sa, 03.01.09:
Freiburg ab: Sa, 03.01.09 06:52
Bruchsal ab: Sa, 03.01.09 15:44 (Aufenthalt in Karlsruhe Hbf für etwa 45-60min)

Für den ICE um 17:08 ab Karlsruhe in Richtung Freiburg gibt es definitiv einen SP50 für 28,50€.
Denn wenn ich nur eine Fahrt von FR nach KA buche und diese Züge auswähle, erhalte ich einen SP50.

Auch diese Kombination ist mit einem SP50 möglich:
Freiburg ab: Sa, 03.01.09 06:52 (ICE, EC)
Bruchsal ab: Sa, 03.01.09 16:48 (IC, ICE)

Der mögliche Bug: Wenn ich für die Hinfahrt um 06:52 die Rückfahrt wählen möchte, erscheint mir im Browser eine Art Popup-Fenster. Dort kann ich die Uhrzeit und ein via-Ziel (hier Karlsruhe Hbf) und die Aufhenthaltzeit festlegen, z.B. 00:50.
Aber genau diese Einstellung wird mir ignoriert. Die möglichen Rückfahrten werden alle ohne Aufenthalt in KA ausgegeben. Klicke ich auf den Link "weitere Angaben ändern" neben dem grauen "Aktualisieren" weiter oben, sind die Zeilen Über(1) und Über(2) wieder zurückgesetzt.
Trage ich dort wieder KA mit Aufenthalt ein, werden mir wieder die Hinfahrten ausgelistet und darf wieder eine Rückfahrt wählen. Die Angaben für den Aufenthalt sind wieder verschwunden.

Das Verhalten ist unabhängig von meinem IE oder Firefox :-(

Natürlich könnte ich den SP50 ab 16:48 in Bruchsal buchen, aber das ist ein IC und für diesen gilt eine Zugbindung. D.h. ich darf keinen anderen Zug nehmen, also auch keinen Regionalzug. Für diese Rückfahrt gibt es also keinen Verlauf im Nahverkehr.

Was kann ich nun tun?